病原菌为梅果丛梗孢Monilia mumecola Y. Harada，无性型为丛梗孢属Monilia，有性型为真菌界子囊菌门链核盘菌属Monilinia。在PDA培养基上，菌落灰白色，垫状，边缘裂状。菌丝有隔，多分枝。分生孢子梗较短，分枝，顶端串生分生孢子。分生孢子卵圆形或柠檬形，无色，大小14～18μm×5～8μm，产孢较少。

病原菌在僵果或病枝上越冬。翌年春季病原菌产生分生孢子，借风雨传播进行初侵染。当幼果形成后，病原菌可通过皮孔、气孔侵入果实，但以伤口侵入为主。20℃～25℃、多雨、多雾有利于褐腐病发生。开花期遇雨，气温较低时容易发生花腐。蝽象、桃蛀螟等害虫的为害常为病原菌提供侵染的机会。果实膨大期，若遇暴风雨、冰雹等自然灾害，造成果实表面伤口多，也有利于病原菌的侵入而导致发病。

（1）清除病残体  木瓜收获后，结合冬季修剪，剪除病枝，摘除病果、僵果，集中深埋或烧毁，减少越冬菌源。

（2）防桃蛀螟  该虫是为害木瓜果实的重要害虫，6月中下旬，正当木瓜果实膨大时，雌蛾卵产于果实梗凹和贴缝空隙处，幼虫孵化后咬破果皮蛀入果内。可在幼虫孵化期，喷90%晶体敌百虫1000倍液或杀螟松乳剂1500倍液，每隔7天喷施1次，连喷3次。

（3）药剂防治  木瓜发芽前，喷1次5波美度的石硫合剂。木瓜落花后至果实采收前1个月喷50%多菌灵600倍液、50%甲基托布津800倍液，喷施次数视病情而定。